Balti-Ameerika Partnerlusprogrammi eesmärk on aidata kaasa kodanikuühiskonna kujunemisele Eestis. Selle saavutamiseks toetame ettevõtmisi, mille eesmärkideks on:
- kodanikuühenduste tegevust toetava keskkonna loomine
- kodanikuühenduste institutsionaalse võimekuse kasv
- kodanikualgatuse tugevdamine ning erinevate ühiskonnasektorite koostöö süvendamine.

BAPP jagab toetusi nii avalike konkursside kaudu kui algatab ka ise erinevaid projekte. Info käimasolevate konkursside kohta avaldatakse ajakirjanduses. Otsused toetuste kohta teeb kohalik nõuandev kogu.

Balti-Ameerika Partnerlusprogrammi tegevust finantseerib Balti-Ameerika Partnerlusfond, mis loodi 1998.a. Ameerika Ühendriikide Rahvusvahelise Abi Agentuuri (USAID) ja Avatud Ühiskonna Instituudi (Open Society Institute) poolt, et toetada kodanikuühiskonna arengut Eestis, Lätis ja Leedus järgneva 10 aasta jooksul. Eestis koordineerib Balti-Ameerika Partnerlusprogrammi tegevust Avatud Eesti Fond.